Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms