Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZBP47756 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms