Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRATP43155 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRATP43155 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRATP43155 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRATP43155 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms