Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms