Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms