Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNB1P35222 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms