Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL9P32969 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL9P32969 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL9P32969 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL9P32969 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL9P32969 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL9P32969 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL9P32969 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL9P32969 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL9P32969 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL9P32969 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms