Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms