Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms