Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP1P29466 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms