Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMA5P28066 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMA5P28066 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMA5P28066 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMA5P28066 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMA5P28066 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMA5P28066 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMA5P28066 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMA5P28066 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMA5P28066 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMA5P28066 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMA5P28066 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMA5P28066 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMA5P28066 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms