Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
HMGB2P26583 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms