Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms