Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRZ1P23471 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1P23471 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms