Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA6P23229 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms