Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms