Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms