Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms