Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms