Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPCAMP16422 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPCAMP16422 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPCAMP16422 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPCAMP16422 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPCAMP16422 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPCAMP16422 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EPCAMP16422 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EPCAMP16422 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EPCAMP16422 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EPCAMP16422 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EPCAMP16422 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EPCAMP16422 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EPCAMP16422 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms