Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRF1P14222 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PRF1P14222 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PRF1P14222 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PRF1P14222 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRF1P14222 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRF1P14222 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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