Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms