Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms