Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms