Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3O75365 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PTP4A3O75365 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTP4A3O75365 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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