Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms