Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBDO15205 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBDO15205 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBDO15205 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBDO15205 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBDO15205 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
UBDO15205 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBDO15205 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBDO15205 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBDO15205 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBDO15205 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBDO15205 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBDO15205 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBDO15205 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms