Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3BO15066 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms