Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2K7ER74 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms