Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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