Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf172C9J069 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf172C9J069 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf172C9J069 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms