Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms