Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms