Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EME2A4GXA9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EME2A4GXA9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms