Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF22A3QJZ6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF22A3QJZ6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF22A3QJZ6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF22A3QJZ6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF22A3QJZ6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF22A3QJZ6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRAMEF22A3QJZ6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF22A3QJZ6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms