Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVW-1Q9UQF0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms