Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEU3Q9UQ49 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms