Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms