Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCG2Q9UNQ0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCG2Q9UNQ0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCG2Q9UNQ0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCG2Q9UNQ0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCG2Q9UNQ0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCG2Q9UNQ0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCG2Q9UNQ0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCG2Q9UNQ0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCG2Q9UNQ0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCG2Q9UNQ0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCG2Q9UNQ0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG2Q9UNQ0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms