Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms