Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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