Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms