Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms