Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPG2Q9UBF2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms