Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFIP11Q9UBB9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFIP11Q9UBB9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms