Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00474Q9P2X8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms