Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHPF2Q9P2E5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms