Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CALCOCO1Q9P1Z2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CALCOCO1Q9P1Z2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CALCOCO1Q9P1Z2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CALCOCO1Q9P1Z2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CALCOCO1Q9P1Z2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CALCOCO1Q9P1Z2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CALCOCO1Q9P1Z2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CALCOCO1Q9P1Z2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CALCOCO1Q9P1Z2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO1Q9P1Z2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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