Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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GDE1Q9NZC3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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