Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms